Barrapunto

a) No tiene sistema de gestión de color (perfiles ICC y tal), para asegurar la concordancia de color entre el monitor, dispositivos de entrada y de salida. Para el que no sepa por qué es tan importante, esta página (en inglés) [normankoren.com] está muy bien.

b) No soporta archivos de 16 bits, como los que generan muchos escáneres de gama alta. Es casi imprescindible para los escáneres de diapositivas y negativos.

Estos dos problemillas quizás no sean tan importantes si lo que quieres es retocar algunas fotos para la web, pero impiden que se adopte el Gimp como sustituto del Photoshop en la industria gráfica.